Игра Cave Story включена в книгу "1001 видеоигра, в которую нужно сыграть прежде, чем умереть" под редакцией Тони Мотта (Tony Mott).
Во многих отношениях игра задала тренд в области качества для инди-платформеров. Это также привело к тому, что в сообществе инди-игр заговорили об оригинальности игры. Новые игры, даже часто совершенно другого жанра, часто описываются как подделки под Cave Story, но в основном несерьезно и скорее как простая шутка.