На планете LV1201 были обнаружены древние инопланетные руины. Корпорация Вейланд-Ютани создает в этом районе исследовательский центр, чтобы изучить и раскрыть секреты раскопок. Когда в руки исследователей попадают ксеноморфные яйца, доктору Айзенбергу поручается руководство научным прогрессом. Вейланд-Ютани также нанимает боевую группу поддержки под командованием генерала Рыкова для обеспечения безопасности объекта.
С течением времени устанавливаются наблюдательные капсулы для слежения за искусственным ксеноморфным ульем. Ксеноморфам, однако, удается избежать сдерживания, и на фоне возникшего хаоса база посылает сигнал бедствия, который привлекает внимание инопланетного вида Хищника, а также отправляет колониальный корабль USS Verloc для оказания помощи.
Aliens Versus Predator 2 — продолжение шутера от первого лица Aliens Versus Predator. Сиквел использует основные концепции игрового процесса первой игры и создает тщательно переплетенную историю между всеми тремя видами, а не три отдельные несвязанные истории для каждой расы, как в первой игре.
Кампания Чужого позволяет вам наводить ужас на свою жертву, ползая по стенам и набрасываясь на врагов. У Хищника есть все оружие и способности, которые вы можете себе представить, например умение маскировки и плазмакастер. Кампания морского пехотинца, хотя и самая привычная с точки зрения игрового процесса, вызывает много напряжения и страха, когда вы играете за одинокого морпеха, сталкивающегося с сотнями ксеноморфов, приближающихся со всех сторон.