В версиях под различные платфорсы игра включает разных эксклюзивных персонажей. PSP версия имеет Hawkeye, Ronin, Black Widow и Captain Marvel, в то время как Wii, Xbox 360 и PS3 имеют Moon Knight и Colossus. Эти персонажи не появляются на других платформах.
26 апреля 2007 года на Xbox Live Marketplace были выпущены дополнительные персонажи для версии Xbox 360. Там была группа героев с Cyclops, Nightcrawler, Hulk и Hawkeye, а группа злодеев с Dr. Doom, Sabertooth, Venom и Magneto. Также было выпущено Золотое издание со всем дополнительным контентом на диске.
В игре персонаж Weasel просит игрока выяснить, кто из двух хакеров заслуживает доверия, чтобы помочь ему взломать компьютерные файлы S.H.I.E.L.D. для игрока. Правильный ответ - C.B. Cebulski, который в реальной жизни считается "консультантом Marvel" для Raven Software в этой игре.
