Команда спецназа отправляется на остров Ибис, правительственный объект. Их цель - расследовать сообщения о том, что доктор Эдвард Кирк, всемирно известный ученый, предположительно умерший два года назад, проводит секретный оружейный проект. Становится очевидным, что Кирк проводил эксперименты по спасению динозавров от вымирания, правительственный объект находится в руинах и пал жертвой гнева динозавров. Вы берете на себя роль Регины, ключевой героини игры, поскольку она изо всех сил пытается проникнуть на объект и узнать правду об опасном эксперименте Кирка. Сопровождаемая на остров Риком и Купером; Регина входит в состав рейдовой группы Секретной операции (SORT) и должна найти и задержать Кирка, одновременно уничтожая заражение, которое распространилось по всему объекту.
Dino Crisis разработан в стиле геймплея survival horror серии Resident Evil, со многими сходствами, включая управление персонажами, нехватку боеприпасов и фиксированные ракурсы камеры. Однако бой сделан значительно более сложным и продвигает идею бегства, а не борьбы, даже больше, чем Resident Evil. Динозавры-велоцирапторы, с которыми игрок будет регулярно сталкиваться, гораздо более живучи, чем большинство врагов, встречающихся в Resident Evil, и могут выдержать большее урона. Они могут преследовать игрока по нескольким комнатам, если тот решит убежать. Если динозавр сбивает Регину с ног, она может уронить свое оружие, заставляя игрока вспомнить о нем при обороне.
В Dino Crisis игрок сталкивается с файлами и документами, которые помогают продолжить предысторию или, возможно, помочь в решении одной из многочисленных головоломок на протяжении всей игры. Однако файлы не будут заархивированы в инвентаре игрока при чтении, как в Resident Evil, и вместо этого игроку потребуется вручную записать любые известные пароли или что-то подобное.