Готэм-Сити находится под атакой. Гнусный Пингвин и его сообщник Двуликий снова создают проблемы. Игроки должны помочь Бэтмену и Робину остановить этих подлых врагов в Batman: Justice Unbalanced. Таинственно тикающие, украшенные драгоценными камнями яйца были доставлены трем известным гражданам Готэма. Игроки присоединяются к динамичному дуэту, чтобы обезопасить тикающие яйца, обезвредить их, а также обнаружить и расшифровать содержащиеся в них сообщения.
Главные герои путешествуют по Готэм-Сити на бэтмобиле, чтобы собрать улики, используя захватные крюки Бэтмена и батаранги, но они не могут разблокировать определенные области, пока не поиграют некоторое время. Игроки должны играть в логические игры, чтобы преодолевать препятствия, созданные злодеями. В одном из них они помогают Бэтмену и Робину подслушивать разговоры приспешников Пингвина, чтобы определить, как отключить систему сигнализации. В другом случае они выравнивают шестигранные роботизированные зонтики, образуя полную схему из подходящих цветов и узоров. Игра рассчитана на детей в возрасте от 7 до 10 лет.